تقطیر چند اثره (MED) دومین روش نمکزدایی حرارتی از نظر ظرفیت نصب شده در سراسر جهان است. مشابه فرآیند تقطیرناگهانی چند مرحله ای (MSF)، عملکرد فرآیند MED به تعداد مراحل بستگی دارد. بدین صورت که ابتدا آب شور بر روی دسته های لوله که حاوی بخار داغ هستند و به عنوان مبدل حرارتی عمل می کنند، اسپری می شود. در نتیجه انتقال حرارت از طریق دیواره های لوله، بخشی از آب شور در قسمت بیرونی لوله تبخیر می شود. بخار تولید شده در قسمت بیرونی لوله ها فاقد نمک بوده و به مرحله بعد می رود. در مرحله بعد، این بخار داخل  لوله ها را گرم می‌کند، و به آب شیرین‌شده متراکم می‌شود. مجدداً، آب شور (این بار با فشار کمتر) در قسمت بیرونی دسته ها اسپری می‌شود و در آنجا تبخیر می‌شود و این فرآیند تکرار می‌شود. MED را می توان طوری طراحی کرد که در دمای پایین تر از MSF کار کند. این بدان معنی است که می تواند از بخار درجه پایین تر (کاهش هزینه) به عنوان ورودی گرما استفاده کند.